Los niños con CIA grandes comúnmente tienen un soplo en el corazón.  El soplo es causado por el flujo excesivo de sangre a través de la válvula pulmonar.  Algunos niños pueden tener falta de aire o palpitaciones cardiacas.  Sin embargo, los niños son normalmente activos y no muestran otros síntomas externos.  No hay restricciones en el ejercicio en estos niños.

Entre más grande sea el defecto, el niño es más propenso a tener síntomas. Los lactantes con una CIA grande pueden desarrollar falla cardiaca congestiva. Sin embargo, si el defecto es pequeño (menos de 2 milímetros), existe una posibilidad alta que el CIA se cierre por sí sola.  Usualmente, en estos casos no se requiere de cirugía.

En CIA más grandes, más propensas a mantenerse abiertas, hay un flujo excesivo de sangre en la aurícula derecha, ventrículo derecho, y en la arteria pulmonar (ver la animación).  Esto causa que la aurícula derecha y el ventrículo derecho se agranden (dilatación), que aumente la presión interna de las arterias pulmonares y que, con los años, se  distorsione la forma de las arterias y en ocasiones, se dañen los vasos sanguíneos de los pulmones.

El crecimiento de la aurícula derecha puede predisponer a que el paciente desarrolle ritmos cardiacos anormales y pueden mantenerse a pesar de que se cierre la CIA.  El adulto joven puede desarrollar insuficiencia cardiaca si la CIA no se le ha cerrado aún.